Skip to content

bernspe/XrayLabel

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

3 Commits
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Anleitung für das Xray-Label Tool ExtractXrayCobb.py

Voraussetzungen

  • Python mit den Standardpaketen
  • opencv,Installation über Kommandozeile mit pip install opencv-contrib-python
  • pyarrow für das Lesen der Parquet-Datei

Dokumentation des Workflows als Film: https://www.dropbox.com/sh/nkapz9lcdzse99w/AAD1aLnj-yKK3l6CxRf2v75ba?dl=0

Workflow

Der Normale Workflow sollte folgendermassen zusammengefasst sein:

  • Markieren der Wirbel -> l -> v -> Einzeichnen der Neutralwirbelkippungen -> v -> s (wenn zufrieden und nicht nochmal angeschaut werden muss) -> n
  • Wenn ihr fertig seid, hätte ich gern alle Dateien als dem Verzeichnis xraydata (außer das .parquet – File) wieder zurück.

Befehle

Taste Befehl Erklärung
n next Nächstes Bild
ESC Abbruch des Programms (speichert automatisch)
r remove Entfernt den kompletten Bilddatensatz aus der Labeldatei (z.B. wenn das Bild unbrauchbar ist)
l lines erzeugt die automatische Spline entlang der mittig markierten Wirbelkörper und misst automatisch den COBB Winkel
v validate hier lassen sich die Eckpunkte für die manuelle COBB-Winkel-Messung einzeichnen. Nochmaliges Drücken von v erzeugt die Winkel und komplettiert den Datensatz.
d discard löscht evtl. vorhandene Linien und du kannst nochmal versuchen.
s save&seal fixiert den Datensatz, so dass die Datenarbeit an dem Bild für abgeschlossen erklärt wird. Das Bild wird dann beim Neustart des Tools nicht nochmal aufgerufen

About

Standing Xray Spine label tool

Resources

License

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages